No soy experto en la materia, pero analizando tu caso, creo que todo lo puedes hacer en una sola escritura de modificación, para ello, tendrán que convocar a Junta General para emitir los acuerdos pertinentes, y en atención al aforismo que dice que las cosas se desacen así como se hacen, en lo referente al acuerdo con número equivocado, me inclinaría a que se señale en el acuerdo, que fue un error, y que en esa Junta establecen ese error, pero que queda subsanada.
Pero no está de más hacer una consulta al Registro de Comercio, sobre ese punto, marcando al 22618600, espero le pueda servir de mucho.
Att.