Podes apelar pero vale la pena hacerlo si crees que la prueba que presentaste fue suficiente para acreditar la separación de 1 o mas años consecutivos, y que el juez erro en la valoración de la misma, tomando en cuenta que una apelación podría tomar varios meses, pero si como tu reconoces fueron los testigos que presentaste los que se equivocaron en el interrogatorio no vale la pena hacerlo, pues la cámara confirmaría la resolución y perderías tu tiempo, y lo mejor seria dejar que quede firme la sentencia, solicitar la devolución de la documentación y volverla a presentar.
Y no debe sentirse mal por lo que paso, uno como abogado se encarga de la parte jurídica, pero no puede sopesar si el testigo esta hablando cosas que no le constan o se pone nervioso, eso es algo que sale del alcance del abogado, y hay mucha gente que por mas que se le instruya al respecto, en el momento oportuno los nervios le ganan y no responde bien, la cual es de su exclusiva responsabilidad y debe hacersele ver al cliente.